Познакомиться с музеем-заповедником можно самостоятельно, но более глубокое представление об этом месте дадут экскурсии. Официальный сайт «Томской писаницы» анонсирует разные направления пеших прогулок с гидом.
На сегодняшний момент на территории музея-заповедника действует более 10 постоянных экспозиций, доступ к которым открыт круглый год:
- Древнее святилище «Томская писаница» — самое главное место в заповеднике. Это 280 работ наскального искусства бронзовой эпохи и раннего железного века.
- Мифология и эпос — экспозиция, которая представляет собой реконструкцию культовых мест народов Северной и Центральной Азии.
- «Археодром» — отстроенные в полную величину древние жилища и захоронения.
- Музей наскального искусства Азии, представляющий собой самое крупное хранилище копий наскальных изображений народов Азии.
- «Время и календари» — экспозиция, посвященная счетно-календарным системам народов мира.
- Славянский мифологический лес, демонстрирующий, как выглядело древнеславянское капище. Здесь можно увидеть макеты идолов славянских божеств.
- «Широкий улус Кезек» — комплекс, представляющий собой реконструкцию усадьбы зажиточного шорца (тюркоязычного представителя населения Сибири) и хозпостроек.
- Монгольская юрта, которая показывает, как был организован быт кочевников и скотоводов.
- Зона «Сказка» — резиденция кузбасского Деда Мороза и прилегающий к ней сказочный городок.
- Часовня Святых Кирилла и Мефодия — небольшой действующий храм, выстроенный в соответствии с канонами древнерусского зодчества.
- Геология Кузбасса, представляющая фрагменты различных горных пород, составляющих недра Кемеровской области.
Также в «Томской писанице» предлагаются интерактивные экскурсии, речная экскурсия к острову серой цапли на катере, конные прогулки и даже спортивные экскурсии. Последний вариант предполагает перемещение по территории заповедника на самокате или гироскутере совместно с гидом.
В среднем одна экскурсия занимает от 45 до 60 минут. Большинство программ доступны для детей любых возрастов. Заявки на большую часть экскурсии необходимо подавать за 3–5 дней. Полноценные экскурсии в «Томскую писаницу» из Томска, Новосибирска, Югры и Новокузнецка тоже организуются. В этом случае туристические фирмы предлагают полное сопровождение, включающее доставку туда и обратно.
Принятая концепция музея включала также собственную зону с вольерами для животных, которые являлись представителями западно-сибирской фауны. Однако реализация этой части проекта постоянно откладывалась. Толчком к действию стал случай. В «Томскую писаницу» привезли медвежонка, найденного в лесах в полном одиночестве. Возможно, его мать убили охотники. Детеныш был обречен на гибель, но неравнодушные люди забрали его и обратились к руководству «Томской писаницы» с просьбой приютить зверя. Так, он стал первым жителем музея-заповедника. Постепенно появлялись и другие животные с непростой судьбой: раненые, брошенные. Сегодня на территории функционирует целый зоопарк.